Los descubrimientos de Schliemann en Micenas y Troya y los de Evans en Cnoso, además de sacar a la luz los primeros tiempos de Grecia, hizo que los arqueólogos dirigieran también su atención hacia los restos de la Edad de Piedra. En 1901, Staïs, éforo de las antigüedades de Tesalia, había excavado el flanco de una colina cercana a Dímini, con la esperanza de encontrar una tumba circular: un tholos. Así descubrió los fundamentos de casas o de murallas, e hizo llamar a Christos Tsountas para que emprendiera sobre el lugar excavaciones exhaustivas.

Tsountas ya había participado en las excavaciones de Micenas, y había descubierto el tholos de Vaphio, donde aparecieron las famosas tazas de oro. También había explorado tumbas de cúpula y otros sitios arqueológicos en el Peloponeso y en las Cíclades. Tras el encargo de Staïs, Tsountas sacó a la luz las dos acrópolis tesalias de Dímini y de Sesklo (1) . Con sus excavaciones aportó elementos científicos que iban a dotar a la arqueología neolítica de sólidos cimientos. A partir de esta época, la exploración de los sitios neolíticos se desarrolla considerablemente y Tesalia se muestra como el lugar más importante del neolítico griego.

Los sitios prehistóricos se presentan, bien bajo la forma de un nivel profundo en una excavación estratigráfica, bien bajo el aspecto de una acrópolis, como la de Sesklo, o bien como un alto túmulo oblongo, como una colina en forma de cono truncado. Estos cerros se conocen con el nombre de magoulas.

II. El Neolítico en Grecia
La cronología de los distintos sitios arqueológicos no es completamente coetánea, por lo que resulta preferible estudiar independientemente cada una de las grandes áreas arqueológicas que se distinguen en el Egeo: Grecia continental, Creta, las Cíclades y Chipre (2) . En cada una de estas áreas el Neolítico se desarrolla, no obstante, en cuatro etapas generales, cada una de ellas susceptibles de nuevas divisiones: Período acerámico o Protoneolítico, Neolítico Antiguo, Neolítico Medio y Neolítico Reciente.

1. Grecia continental

1.1. El Protoneolítico o Neolítico acerámico.

Este período fue descubierto por vez primera por Miloijcic y Jung  durante un estudio estratigráfico de la magoula de Argisa. El objetivo de su excavación era, precisamente, revelar la existencia de un estadio precerámico en Grecia, en relación con el Neolítico del Próximo Oriente (3) . Por debajo de los niveles del Bronce, del Calcolítico y del Neolítico que se suceden sin solución de continuidad, las excavaciones sacaron a la luz un nivel Protoneolítico. Más tarde, M. Teocharis reveló varios estratos protoneolíticos en Sufli Magoula, a partir de los cuales distinguió tres períodos que, en general, se aplican desde entonces al conjunto del período Protoneolítico: Precerámico I, en el que el suelo de las casas estaba formado por guijarros y donde se han encontrado indicios de destrucción por el fuego; Precerámico II, que presenta tres o cuatro capas que constituyen los sucesivos suelos de viviendas de arcilla levantadas una sobre otra; y el Precerámico III, que presenta también indicios de incendio. Todos ellos están en inmediato contacto con niveles cerámicos (4) .

El utillaje lítico encontrado en estos lugares es de tradición mesolítica. Las dos variedades principales de piedra que se utilizaban eran el sílex y la obsidiana. La mayoría las piedras talladas que se han encontrado son de pequeño tamaño. También se trabajaban y utilizaban huesos como armas y herramientas. Asimismo, se han encontrado unas bolas de arcillas oblongas que se piensa han podido servir como balas de honda. También han aparecido instrumentos para trabajar la piel.

Las viviendas del Protoneolítico no parecen haber variado a lo largo de este período. Estaban constituidas por una sola habitación, cuadrada o rectangular, posiblemente con un porche cubierto. Eran cabañas construidas con palos de madera clavados en el suelo y que sostenían un muro hecho de caña y ramas, quizá cubierto de follaje. En algunas de estas viviendas se han encontrado dos pisos excavados en el suelo: uno era un hogar lleno de huesos animales y pequeñas piedras; el otro encerraba diversos instrumentos de sílex, probablemente un almacén de instrumentos.

1.2. El Neolítico antiguo en Tesalia y la cuestión cronológica

Mientras que el Protoneolítico no está atestiguado más que en Tesalia, la primera fase del Neolítico ya con cerámica, el Neolítico Antiguo, se encuentra ampliamente extendido. 
En este período el lugar más importante es Sesklo, cuya influencia se va a extender hasta Macedonia y Beocia. La nomenclatura de las diferentes culturas cercanas a Sesklo varía según los autores. Utilizando los resultados obtenidos en las excavaciones de los distintos niveles de Sesklo realizadas por M Teocharis antes de emprender sus trabajos en Sufli Magoula, y los sondeos en otros puntos de Tesalia, M Milojcic ha establecido una nomenclatura para el Neolítico Antiguo que es la que se utiliza desde entonces:

A) Neolítico Antiguo I, fase en la que aparecen las primeras muestras de cerámica.
B) Neolítico Antiguo II o Proto-Sesklo.
C) Neolítico Antiguo III o Preseklo.
D) Neolítico Antiguo IV o Sesklo.

Estas cuatro etapas eran seguidas por el Neolítico reciente de Dímini, pero la tipología a llevado a situar entre el Neolítico Antiguo y el Reciente una etapa intermedia que corresponde al Neolítico Antiguo IV de Milojcic, la cultura de Sesklo, subdividida a su vez en tres períodos. De esta manera, la cronología del Neolítico en Grecia continental, queda como sigue:

1. Neolítico Acerámico o Protoneolítico (ca. 7000-6200 a.C.)
2. Neolítico Antiguo (ca. 6200-5500 a.C.)
A) Neolítico Antiguo I: Proto-Sesklo (ca. 6200-6000 a.C.).
B) Neolítico Antiguo II: cerámica monocroma antigua (ca. 6000-5700 a.C.).
C) Neolítico Antiguo III: Pre-Sesklo (ca. 5700-5500 a.C.)
3. Neolítico Medio: Sesklo (ca. 5500-4200 a.C.)
A) Neolítico Medio I: Sesklo I (ca. 5500-5000 a.C.)
B) Neolítico Medio II: Sesklo II (ca. 5000-4600 a.C.)
C) Neolítico Medio III: Sesklo III (ca. 4600-4200 a.C.)
4. Neolítico Reciente (ca. 4300-3300 a.C.)
A) Tsangli-Arapi (ca. 4300-3800 a.C.)
B) Dímini (ca. 4000-3200 a.C.)
a) Dímini I (ca. 4000-3600 a.C.)
b) Dímini II (ca. 3600-3400 a.C.)
c) Dímini III (ca. 3400-3200 a.C.)
d) Dímini IV (Larisa) (ca. 3200 a.C.)

Debería, sin embargo, retrasarse el comienzo del Neolítico cerámico en, al menos, 200 años, ya que el más antiguo testimonio del trabajo de la cerámica en Grecia continental se encuentra en Nea Nikomedía, en Macedonia, fechado por la técnica del radiocarbono en 6220 a.C.

1.3. Nea Nikomedía
Es, como decimos, el lugar neolítico más antiguo y se divide en dos fases. Las casas están construidas con los mismos materiales en los dos estratos. Son de planta rectangular, con postes fijados en el suelo que sujetan un techo de caña endurecido con arcilla. Los suelos son de tierra batida cubierta de ramaje y hierbas. En el primer período cuentan con una sola habitación de 8 x 8 m de media. En el segundo período, tienen ya dos habitaciones. En el nivel inferior ha aparecido una construcción de 12 m de largo, dividida en tres salas por filas de postes perpendiculares a los muros largos. En esta construcción se han encontrado estatuas femeninas de arcilla cruda, dos grandes hachas de piedra verde, cantimploras de cerámica y tazas montones de láminas de sílex que hacen pensar en un uso religioso de la casa. También se ha pensado que sea la casa del jefe o el lugar donde se reunía una especie de “consejo de ancianos”.
En el nivel más antiguo de Nea Nikomedía se han encontrado vasos decorados con incisiones hechas con las uñas (del tipo llamado A2) y vasos rojos sobre fondo blanco, blancos sobre fondo rojo y marrón (del tipo A3). La cerámica monócroma se presenta con labios simples y desembocaduras anchas o ligeramente cerradas. La mayoría de los vasos presenta una cobertura rosa, en ocasiones roja o gris. 
Han aparecido también varias figurillas de terracota que representan a mujeres rollizas —tipo esteatopígico— cuyos ojos están señalados mediante cortes (5).

1.4. Otros lugares del continente

Además de los grandes sitios arqueológicos de Sesklo y Nea Nikomedía, otros lugares han ofrecido restos del período neolítico que, aunque menos abundantes, presentan gran interés.
Entre ellos, destaca Arapi, al lado de Sesklo, donde ha aparecido una cerámica con incisiones decorada  à la barbotine que difiere de los estilos contemporáneos de la vecina Sesklo.
Importante es también Rachmani, excavada en 1910 por Wace y Thompson, cuya ocupación se extiende sin solución de continuidad del Neolítico antiguo a la Edad del Bronce. Rachmani presenta series de cerámica propias: vasos decorados en rosa sobre fondo rojo, monocromos blancos, copas y pequeñas ánforas monocromas negras, pequeñas copas abiertas decoradas en ocre sobre fondo gris oscuro, vasos decorados en ocre sobre fondo blanco.

Otro lugar importante del Neolítico griego es Elatea, en Fócide, donde las excavaciones de S. Weinberg han sacado a la luz una cerámica monócroma de formas simples cuya evolución puede seguirse fácilmente. Los tintes varían del marrón claro al gris oscuro e incluso negro. La cerámica pintada aparece bajo la forma de la serie conocida con “de Queronea”, de decoración oscura sobre fondo claro, que evoluciona a una cerámica con complejos motivos geométricos, rojos u ocres sobre fondo blanco. Las construcciones encontradas revelan una arquitectura idéntica a la de Sesklo o Nea Nikomedía. Elatea constituye el único lugar donde los distintos niveles se han podido fechar mediante el C 14 (con un margen de ±70 años). Así se ha establecido la siguiente cronología del lugar:

1. Neolítico Antiguo, 5530-5100 a.C.
2. Neolítico Medio, 5000-4000 a.C., caracterizado por la cerámica de Queronea y del tipo Urfirniss (“de barniz antiguo”).
3. Neolítico Reciente, 4000-3200 a.C., con una cerámica de color mate, polícroma de tipo B 3 o pulida gris.

Contemporáneo de Elatea parece ser Magoula Bolomenou, en Queronea (Beocia), donde ha aparecido la famosa cerámica con decoración oscura sobre fondo claro, llamada precisamente “de Queronea”, porque se creía propia del lugar, aunque ha aparecido también en otras zonas.
Otro yacimiento importante de Beocia es Eutresis, donde los niveles Neolíticos no ha podido ser bien estudiados por las perturbaciones de los estratos, pero donde se ha encontrado una cerámica monócroma pulida que corresponde a una época contemporánea de finales del Neolítico Medio. Las viviendas eran cabañas circulares.

En el Ática, el lugar más importante se encuentra en Nea Makri, al sur de Maratón. Las excavaciones han ofrecido cinco niveles de los cuales dos corresponden al Neolítico antiguo y tres al Neolítico Reciente. La comparación con otros lugares ha permitido fechar el primer nivel en la época del Protosesklo.

Por lo que se refiere al Peloponeso, los lugares más importantes son Mathi, en Mesenia, y Lerna, en la actual Myloi. La cerámica de Malthi presenta múltiples analogía con la cerámica de Albania y de Italia oriental, así como de Grecia occidental, por lo que algunos la denominan “cerámica adriática”. La cerámica de Lerna presenta distintos tipos: negras o grises, monocromas, de tipo abigarrado.